Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms