Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRR3Q9UBC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRR3Q9UBC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms