Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3BQ9UBC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT3BQ9UBC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms