Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL13Q9P2N7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms