Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAMSAP3Q9P1Y5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms