Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CWC25Q9NXE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms