Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RLIMQ9NVW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RLIMQ9NVW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms