Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PDS5BQ9NTI5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PDS5BQ9NTI5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PDS5BQ9NTI5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms