Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDREJQ9NTG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKDREJQ9NTG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms