Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRDM7Q9NQW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRDM7Q9NQW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms