Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB3Q9NPA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB3Q9NPA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB3Q9NPA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms