Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA1Q9NP55 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms