Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUFT1Q9NNX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUFT1Q9NNX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms