Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC24A3Q9HC58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A3Q9HC58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms