Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR55Q9H6Y2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms