Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM12Q9H4Q4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM12Q9H4Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms