Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP2Q9H2M9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAB3GAP2Q9H2M9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAB3GAP2Q9H2M9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP2Q9H2M9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms