Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGPP1Q9BX95 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms