Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP4Q9BWG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms