Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAGR1Q9BTK6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAGR1Q9BTK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAGR1Q9BTK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms