Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKP4Q99569 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms