Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC62Q99442 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SEC62Q99442 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC62Q99442 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC62Q99442 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC62Q99442 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC62Q99442 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC62Q99442 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEC62Q99442 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEC62Q99442 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC62Q99442 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms