Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP5Q96RT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms