Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZIM3Q96PE6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZIM3Q96PE6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms