Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSMCE3Q96MG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms