Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD4Q96DM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms