Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDAQ92838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDAQ92838 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDAQ92838 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDAQ92838 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDAQ92838 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDAQ92838 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDAQ92838 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDAQ92838 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDAQ92838 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDAQ92838 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDAQ92838 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDAQ92838 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDAQ92838 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDAQ92838 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDAQ92838 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDAQ92838 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDAQ92838 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDAQ92838 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDAQ92838 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.3 ms