Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TraipQ8VIG6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraipQ8VIG6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraipQ8VIG6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms