Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATAD1Q8NBU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD1Q8NBU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms