Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF1Q8NBK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUMF1Q8NBK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF1Q8NBK3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms