Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATPAF2Q8N5M1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF2Q8N5M1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms