Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NME8Q8N427 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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