Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN12Q8IYM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN12Q8IYM2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN12Q8IYM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms