Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms