Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube3dQ8BX13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube3dQ8BX13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms