Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF39Q86UA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms