Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R42Q7Z4L9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R42Q7Z4L9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms