Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SETXQ7Z333 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SETXQ7Z333 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SETXQ7Z333 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms