Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
OTOP2Q7RTS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms