Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCIMPQ6UWF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms