Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOA5Q6Q788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA5Q6Q788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms