Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TXNDC11Q6PKC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms