Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL35Q6PF15 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL35Q6PF15 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms