Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO4Q5TGY1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO4Q5TGY1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms