Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1LQ5PSV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1LQ5PSV4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1LQ5PSV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms