Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A4Q4VNC1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A4Q4VNC1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A4Q4VNC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms