Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP28Q4G0W2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP28Q4G0W2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms