Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBB8Q3ZCM7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB8Q3ZCM7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB8Q3ZCM7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms