Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1EQ15878 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms