Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERC1Q15751 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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